Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms