Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms