Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms