Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms