Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD5Q99666 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms