Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms