Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms