Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf72Q96LT7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms