Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms