Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms