Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UTP4Q969X6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms