Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG4Q92954 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRG4Q92954 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRG4Q92954 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRG4Q92954 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRG4Q92954 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRG4Q92954 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PRG4Q92954 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms