Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms