Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms