Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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COPS9Q8WXC6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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COPS9Q8WXC6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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COPS9Q8WXC6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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COPS9Q8WXC6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COPS9Q8WXC6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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