Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms