Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PANK1Q8TE04 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms