Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms