Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms