Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF548Q8NEK5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF548Q8NEK5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF548Q8NEK5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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