Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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