Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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