Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C11orf53Q8IXP5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C11orf53Q8IXP5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C11orf53Q8IXP5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf53Q8IXP5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf53Q8IXP5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C11orf53Q8IXP5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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