Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms