Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms