Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4L9Q6RFH8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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