Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYW3Q6IPR3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms