Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM225Q6GV28 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms