Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms