Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms