Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms