Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBPF8Q3BBV2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms