Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UVSSAQ2YD98 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms