Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms