Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms