Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms