Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms