Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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