Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms