Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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