Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP4Q15650 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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