Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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