Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms