Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms