Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERV3-1Q14264 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms