Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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