Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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