Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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