Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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