Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPP1R1AQ13522 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms